Lehrveranstaltungen

Paralleles Rechnen Seminar

Dozent:innen: Univ-Prof. Dr. Bertil Schmidt
Kurzname: 08.079.22590
Kurs-Nr.: 08.079.22590
Kurstyp: Seminar

Voraussetzungen / Organisatorisches

Voraussetzungen:
Erfolgreiche vorherige Teilnahme an HPC oder Accelerated Computing with GPUs ist Voraussetzung zur Teilnahme.

Themenauswahl:
E-Mail mit 2 bevorzugten Themen bis spätestens 21.7.2023 an Prof. Dr. Bertil Schmidt per E-Mail schicken. Ich werde daraufhin Ihnen ein Thema zuweisen. Es ist auch möglich eigenen Themen vorzuschlagen

Mögliche Themen:

• BWA-MEM-SCALE: Accelerating Genome Sequence Mapping on Commodity Servers
  
• Accelerating Lattice QCD Multigrid on GPUs Using Fine-Grained Parallelization
  
• A fast, lock-free approach for efficient parallel counting of occurrences of k-mers
  
• Tensor-Accelerated Fourth-Order Epistasis Detection on GPUs
  
• Efficient Direct Convolution Using Long SIMD Instructions
  
• Space Efficient Sequence Alignment for SRAM-Based Computing: X-Drop on the Graphcore IPU
  
• Accelerating minimap2 for long-read sequencing applications on modern CPUs
  
• GenDP: A Framework of Dynamic Programming Acceleration for Genome Sequencing Analysis
  
• DistGNN: Scalable Distributed Training for Large-Scale Graph Neural Networks
  
• Tensor Processing Primitives: A Programming Abstraction for Efficiency and Portability in Deep Learning Workloads
  
• A framework for high-throughput sequence alignment using real processing-in-memory systems
  
• Selber vorgeschlagenes Thema (muss aber von mir genehmigt werden)